وُلدت نسبيت في عام 1858 في كيننجتون، لندن، ابنة الكيميائي الزراعي جون كوليس نسبيت، الذي توفي في مارس من عام 1862، قبل عيد ميلادها الرابع. وبسبب مرض شقيقتها ماري الدائم سافرت العائلة إلى العديد من البلدان، برايتون، باكنغهامشير، فرنسا (دييب، روان، باريس، بواتييه، أنغوليم، بوردو، أركاشون، باو، بانيير دو بيجور) وإسبانيا وألمانيا، قبل الاستقرار لمدة ثلاث سنوات في هالستيد هول في شمال غرب كينت، وهو الموقع الذي ألهمها لاحقًا لكتابة أطفال السكك الحديدية.